Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MestQ07646 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MestQ07646 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MestQ07646 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MestQ07646 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MestQ07646 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MestQ07646 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MestQ07646 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MestQ07646 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MestQ07646 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MestQ07646 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MestQ07646 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MestQ07646 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MestQ07646 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MestQ07646 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MestQ07646 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MestQ07646 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MestQ07646 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MestQ07646 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MestQ07646 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MestQ07646 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MestQ07646 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MestQ07646 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MestQ07646 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MestQ07646 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MestQ07646 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MestQ07646 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms