Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a2Q07643 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col9a2Q07643 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms