Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah2Q06986 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms