Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprgQ05909 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprgQ05909 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprgQ05909 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtprgQ05909 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtprgQ05909 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprgQ05909 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprgQ05909 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprgQ05909 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprgQ05909 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms