Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fmn1Q05860 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Fmn1Q05860 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Fmn1Q05860 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms