Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1Q04750 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1Q04750 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1Q04750 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top1Q04750 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1Q04750 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms