Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb1Q02819 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb1Q02819 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb1Q02819 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nucb1Q02819 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms