Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnb1Q02248 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnb1Q02248 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnb1Q02248 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms