Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snai1Q02085 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snai1Q02085 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms