Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gbp10Q000W5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms