Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bop1P97452 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bop1P97452 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bop1P97452 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bop1P97452 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bop1P97452 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bop1P97452 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms