Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CiitaP79621 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CiitaP79621 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CiitaP79621 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms