Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd13P70217 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd13P70217 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms