Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtnP63089 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtnP63089 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms