Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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