Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smg6P61406 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smg6P61406 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smg6P61406 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smg6P61406 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smg6P61406 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smg6P61406 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smg6P61406 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smg6P61406 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms