Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rhbdl3P58873 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdl3P58873 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdl3P58873 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms