Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtnsP57757 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtnsP57757 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtnsP57757 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtnsP57757 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CtnsP57757 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CtnsP57757 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms