Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samsn1P57725 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samsn1P57725 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms