Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1P56716 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1P56716 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1P56716 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1P56716 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp1P56716 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1P56716 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms