Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1P56183 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1P56183 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms