Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd3P55096 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd3P55096 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd3P55096 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd3P55096 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd3P55096 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd3P55096 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd3P55096 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms