Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fdft1P53798 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fdft1P53798 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fdft1P53798 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fdft1P53798 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms