Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Map3k1P53349 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Map3k1P53349 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Map3k1P53349 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Map3k1P53349 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms