Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dbx1P52950 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dbx1P52950 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dbx1P52950 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms