Protein–RNA interactions for Protein: P52875

Tmem165, Transmembrane protein 165, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem165P52875 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem165P52875 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem165P52875 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem165P52875 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem165P52875 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem165P52875 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem165P52875 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem165P52875 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem165P52875 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem165P52875 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem165P52875 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem165P52875 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms