Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen1P49769 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psen1P49769 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psen1P49769 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psen1P49769 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psen1P49769 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psen1P49769 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psen1P49769 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psen1P49769 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms