Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox2P48432 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox2P48432 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox2P48432 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.5 ms