Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl13P47963 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms