Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfkmP47857 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfkmP47857 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfkmP47857 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfkmP47857 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfkmP47857 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfkmP47857 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfkmP47857 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PfkmP47857 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PfkmP47857 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms