Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nedd4P46935 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd4P46935 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms