Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brcc3P46737 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brcc3P46737 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brcc3P46737 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms