Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a2P43006 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc1a2P43006 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.3 ms