Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VhlP40338 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VhlP40338 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VhlP40338 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VhlP40338 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VhlP40338 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VhlP40338 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VhlP40338 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VhlP40338 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VhlP40338 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VhlP40338 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VhlP40338 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VhlP40338 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VhlP40338 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VhlP40338 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VhlP40338 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VhlP40338 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VhlP40338 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VhlP40338 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VhlP40338 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VhlP40338 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VhlP40338 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VhlP40338 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VhlP40338 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VhlP40338 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VhlP40338 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VhlP40338 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VhlP40338 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VhlP40338 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VhlP40338 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VhlP40338 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VhlP40338 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VhlP40338 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VhlP40338 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VhlP40338 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VhlP40338 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VhlP40338 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VhlP40338 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VhlP40338 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VhlP40338 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VhlP40338 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VhlP40338 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VhlP40338 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VhlP40338 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VhlP40338 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VhlP40338 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VhlP40338 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms