Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chd1P40201 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chd1P40201 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd1P40201 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd1P40201 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd1P40201 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chd1P40201 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Chd1P40201 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Chd1P40201 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Chd1P40201 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Chd1P40201 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Chd1P40201 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Chd1P40201 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd1P40201 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd1P40201 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chd1P40201 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Chd1P40201 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms