Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa9P38647 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa9P38647 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hspa9P38647 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa9P38647 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms