Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ly6dP35459 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly6dP35459 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms