Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sftpa1P35242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sftpa1P35242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sftpa1P35242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms