Protein–RNA interactions for Protein: P30681

Hmgb2, High mobility group protein B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb2P30681 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hmgb2P30681 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hmgb2P30681 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hmgb2P30681 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hmgb2P30681 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmgb2P30681 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmgb2P30681 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hmgb2P30681 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hmgb2P30681 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms