Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VtnP29788 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VtnP29788 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VtnP29788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VtnP29788 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VtnP29788 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VtnP29788 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VtnP29788 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VtnP29788 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VtnP29788 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VtnP29788 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VtnP29788 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VtnP29788 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VtnP29788 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VtnP29788 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VtnP29788 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VtnP29788 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VtnP29788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VtnP29788 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VtnP29788 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VtnP29788 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VtnP29788 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VtnP29788 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VtnP29788 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VtnP29788 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VtnP29788 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VtnP29788 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VtnP29788 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VtnP29788 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VtnP29788 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VtnP29788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VtnP29788 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VtnP29788 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VtnP29788 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VtnP29788 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VtnP29788 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VtnP29788 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms