Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp1P29452 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp1P29452 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp1P29452 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp1P29452 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp1P29452 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp1P29452 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp1P29452 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp1P29452 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms