Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IppP28575 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IppP28575 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IppP28575 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IppP28575 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IppP28575 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IppP28575 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IppP28575 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IppP28575 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IppP28575 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IppP28575 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IppP28575 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IppP28575 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IppP28575 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IppP28575 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IppP28575 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IppP28575 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IppP28575 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IppP28575 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IppP28575 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IppP28575 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IppP28575 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IppP28575 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IppP28575 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IppP28575 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IppP28575 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IppP28575 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IppP28575 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IppP28575 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IppP28575 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IppP28575 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IppP28575 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IppP28575 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IppP28575 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IppP28575 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IppP28575 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IppP28575 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IppP28575 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IppP28575 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IppP28575 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IppP28575 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IppP28575 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IppP28575 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IppP28575 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IppP28575 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IppP28575 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IppP28575 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IppP28575 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IppP28575 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IppP28575 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IppP28575 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IppP28575 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IppP28575 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IppP28575 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IppP28575 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IppP28575 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IppP28575 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IppP28575 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IppP28575 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IppP28575 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IppP28575 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IppP28575 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IppP28575 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IppP28575 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IppP28575 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IppP28575 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IppP28575 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms