Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gria1P23818 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gria1P23818 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gria1P23818 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gria1P23818 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gria1P23818 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gria1P23818 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gria1P23818 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gria1P23818 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gria1P23818 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gria1P23818 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gria1P23818 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gria1P23818 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gria1P23818 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gria1P23818 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms