Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd8P23463 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd8P23463 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd8P23463 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms