Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3P21107 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3P21107 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms