Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Prim1P20664 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prim1P20664 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prim1P20664 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prim1P20664 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prim1P20664 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prim1P20664 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prim1P20664 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prim1P20664 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prim1P20664 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms