Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NelfeP19426 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NelfeP19426 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NelfeP19426 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NelfeP19426 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NelfeP19426 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NelfeP19426 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NelfeP19426 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms