Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefhP19246 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefhP19246 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NefhP19246 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NefhP19246 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefhP19246 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefhP19246 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefhP19246 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefhP19246 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NefhP19246 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefhP19246 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefhP19246 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefhP19246 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefhP19246 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefhP19246 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefhP19246 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefhP19246 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefhP19246 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefhP19246 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefhP19246 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefhP19246 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefhP19246 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefhP19246 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefhP19246 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefhP19246 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefhP19246 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefhP19246 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefhP19246 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefhP19246 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefhP19246 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NefhP19246 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefhP19246 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefhP19246 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefhP19246 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefhP19246 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefhP19246 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefhP19246 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefhP19246 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefhP19246 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefhP19246 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefhP19246 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefhP19246 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefhP19246 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefhP19246 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefhP19246 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefhP19246 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefhP19246 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefhP19246 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefhP19246 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NefhP19246 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NefhP19246 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NefhP19246 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefhP19246 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefhP19246 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NefhP19246 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefhP19246 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefhP19246 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefhP19246 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefhP19246 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefhP19246 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefhP19246 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefhP19246 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefhP19246 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefhP19246 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NefhP19246 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefhP19246 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefhP19246 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefhP19246 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefhP19246 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefhP19246 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms