Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh3P13705 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh3P13705 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Msh3P13705 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh3P13705 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh3P13705 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh3P13705 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh3P13705 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms