Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrgnP13609 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrgnP13609 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrgnP13609 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrgnP13609 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrgnP13609 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrgnP13609 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms